ان اختلال عمل الساعة الحياتية يؤدي الى ظهور اعراض غير طبيعية واخرى توصف بأنها مرضية وهنا تكمن أهمية هذه الساعة ، فعلى سبيل المثال فان العيش في اماكن مظلمة ذات اضاءة اصطناعية لا تتوافر فيها الاطوال الموجية المطلوبة التي يمكن الحصول عليها من التعرض لاشعة الشمس ، يعاني الذين يعيشون في هذه الاماكن من عدة اعراض مرضية متمثلا بالكآبة والقلق وفقدان الوعي والشعور بالنعاس.