المرجع الالكتروني للمعلوماتية
المرجع الألكتروني للمعلوماتية

علم الكيمياء
عدد المواضيع في هذا القسم 7879 موضوعاً
علم الكيمياء
الكيمياء التحليلية
الكيمياء الحياتية
الكيمياء العضوية
الكيمياء الفيزيائية
الكيمياء اللاعضوية
مواضيع اخرى في الكيمياء

Untitled Document
أبحث عن شيء أخر



يتطلب بناء النموذج معرفة بالبنية الأولية  
  
120   09:18 صباحاً   التاريخ: 12 / 5 / 2021
المؤلف : د. روبرت موراي وآخرون
الكتاب أو المصدر : هاربرز في الكيمياء الحيوية
الجزء والصفحة : ص 163
القسم : علم الكيمياء / الكيمياء الحياتية / الاحماض الامينية والبروتينات /

يتطلب بناء النموذج معرفة بالبنية الأولية

تكون البلورات البروتينية النموذجية لينة نسبيا وبالتالي فهي مضطربة بمقدار بضعة أنجسترومات. ونتيجة لذلك لا تظهر خرائط كثافة الإلكترونات لمعظم البلورات البروتينية عموماً موضع الذرات بشكل واضح. وتظهر المعطيات عند دقة الفصل (resolution)   2أنج الشكل الجزيئي الإجمالي، في حين تظهر المعطيات عند دقة الميز او الفصل (resolution) 1.5 أنج (الطول الموجي للرابطة التساهمية النموذجية) الذرات المنفردة بشكل جزئي. وتصبح الذرات غير الهيدروجينية مرئية بوضوح عند دقة الميز او الفصل (resolution) 1 أنج. وفي حين تظهر معظم بنى البلورات البروتينية في خرائط كثافة الإلكترونات بشكل ضعيف جدا لا يسمح بإظهار موضع كل من الذرات بوضوح تام، فانه يمكن عادة تعقب مسار هيكل عديد الببتيد وكشف مواضع سلاسله الجانبية واتجاهاتها (الشكل 6-12). وفي واقع الأمر، لا يكن استنتاج بنية البروتين من خريطة كثافة الإلكترونات فقط، ولتمييز الزمر”R‘ ذات الأحجام والأشكال المتماثلة يجب أن تتطابق البنية الأولية المعروفة بالعين مع خريطة كثافة الإلكترونات. ويمكن بمساعدة الحاسوب أن تنقص أخطاء التحديد النهائي لمواضع الذرات إلى نحو 0.1 أنج.

شكل 6-12 : تمثيل لكيفية تطابق بنية أولية معروفة مع نموذج الكثافة الإلكترونية. وتلاحظ الكثافة الإلكترونية للطاق بيتا من النصف الانتهائي الأميني للـ RbsA، وهو الشريط الرابط للآتب (ATP) للناقلة ABC للريبوز من الإشريكية القولونية.




هي أحد فروع علم الكيمياء. ويدرس بنية وخواص وتفاعلات المركبات والمواد العضوية، أي المواد التي تحتوي على عناصر الكربون والهيدروجين والاوكسجين والنتروجين واحيانا الكبريت (كل ما يحتويه تركيب جسم الكائن الحي مثلا البروتين يحوي تلك العناصر). وكذلك دراسة البنية تتضمن استخدام المطيافية (مثل رنين مغناطيسي نووي) ومطيافية الكتلة والطرق الفيزيائية والكيميائية الأخرى لتحديد التركيب الكيميائي والصيغة الكيميائية للمركبات العضوية. إلى عناصر أخرى و تشمل:- كيمياء عضوية فلزية و كيمياء عضوية لا فلزية.


إن هذا العلم متشعب و متفرع و له علاقة بعلوم أخرى كثيرة ويعرف بكيمياء الكائنات الحية على اختلاف أنواعها عن طريق دراسة المكونات الخلوية لهذه الكائنات من حيث التراكيب الكيميائية لهذه المكونات ومناطق تواجدها ووظائفها الحيوية فضلا عن دراسة التفاعلات الحيوية المختلفة التي تحدث داخل هذه الخلايا الحية من حيث البناء والتخليق، أو من حيث الهدم وإنتاج الطاقة .


علم يقوم على دراسة خواص وبناء مختلف المواد والجسيمات التي تتكون منها هذه المواد وذلك تبعا لتركيبها وبنائها الكيميائيين وللظروف التي توجد فيها وعلى دراسة التفاعلات الكيميائية والاشكال الأخرى من التأثير المتبادل بين المواد تبعا لتركيبها الكيميائي وبنائها ، وللظروف الفيزيائية التي تحدث فيها هذه التفاعلات. يعود نشوء الكيمياء الفيزيائية إلى منتصف القرن الثامن عشر . فقد أدت المعلومات التي تجمعت حتى تلك الفترة في فرعي الفيزياء والكيمياء إلى فصل الكيمياء الفيزيائية كمادة علمية مستقلة ، كما ساعدت على تطورها فيما بعد .





السيّد الصافي يكرّم كادر فيلم (أحمد والقمر) ويحثّهم على بذل المزيد
بمشاركة (450) عنوان ثقافي فكري من اصدارتها.. وزير الثقافة يزيح الستار عن جناح العتبة الحسينية في معرض بغداد الدولي للكتاب
سيرة أهل البيت (ع) وقصص الشهداء الملبين لفتوى (الدفاع الكفائي) أكثر ما يجذب رواد جناح العتبة الحسينية في معرض بغداد الدولي
العتبةُ العبّاسيةُ المقدّسة تُعلن عن موعد انعقاد مؤتمر فتوى الدفاع الكفائيّ الخامس