المرجع الالكتروني للمعلوماتية
المرجع الألكتروني للمعلوماتية

علم الكيمياء
عدد المواضيع في هذا القسم 7875 موضوعاً
علم الكيمياء
الكيمياء التحليلية
الكيمياء الحياتية
الكيمياء العضوية
الكيمياء الفيزيائية
الكيمياء اللاعضوية
مواضيع اخرى في الكيمياء

Untitled Document
أبحث عن شيء أخر



تسمح معرفة المدى والأطوار بوضع خريطة لكثافة الإلكترونات  
  
149   09:13 صباحاً   التاريخ: 12 / 5 / 2021
المؤلف : د. روبرت موراي وآخرون
الكتاب أو المصدر : هاربرز في الكيمياء الحيوية
الجزء والصفحة : ص 162
القسم : علم الكيمياء / الكيمياء الحياتية / الاحماض الامينية والبروتينات /

تسمح معرفة المدى والأطوار بوضع خريطة لكثافة الإلكترونات

هناك ثلاثة معالم تميز كل حزمة متعرجة وهي المدى (Amplitude) والطول الموجي (Wavelength) والطور (Phase)، والأخير هو الوحيد الذي يكون مجهولا. ويقوم حل مشكلة الطور عموماً على استبدال متشاكل متعدد Multiple) (isomorphous replacement بحيث يدخل معدن ثقيل أو بين أخر مميز سلفا إما بالتبلور المتزامن (Co-crystallization) أو بالانتشار في البلورة الموجودة نحلل بعد ذلك التغيرات في نموذج الانعراج لتحديد الأطوار بعمليات رياضية تشمل وضع خرائط باترسون (Patterson maps). وتستخدم الأطوار والمدى لحساب خريطة كثافة الإلكترونات للوحدة المتكررة من البلورة.

وتمثل خرائط كثافة الإلكترونات سلسلة من المقاطع المتوازية عبر البروتين ممثل فيها خطوط الكفاف (Contour lines) القريبة من بعضها بعضاً مناطق التغير الكبير في كثافة الإلكترونات. وتماثل خرائط كثافة الإلكترونات الخرائط الطبغرافية التي ممثل فيها خطوط الكفاف القريبة بعضها من بعض مناطق يتغير فيها الارتفاع بشكل حاد. ولقد استخدمت مخزونات. خرائط كثافة الإلكترونات المرسومة على مادة شفافة لتقليد خريطة كثافة الإلكترونات ثلاثية الأبعاد التي أنشئ منها اجتهاداً النموذج الفيزيائي للسلسلة الرئيسية من البروتين بشكل اجتهادي. ولكن التحليل البنيوي المعاصر يستخدم الحواسيب التي تعرض خرائط كثافة الإلكترونات بكفاف ثلاثي الأبعاد بحيث يعكن مطابقتها بالعين مع البنية الأولية المعروفة للبروتين (الشكل 6-12)


شكل 6-12 : تمثيل لكيفية تطابق بنية أولية معروفة مع نموذج الكثافة الإلكترونية. وتلاحظ الكثافة الإلكترونية للطاق بيتا من النصف الانتهائي الأميني للـ RbsA، وهو الشريط الرابط للآتب (ATP) للناقلة ABC للريبوز من الإشريكية القولونية.




هي أحد فروع علم الكيمياء. ويدرس بنية وخواص وتفاعلات المركبات والمواد العضوية، أي المواد التي تحتوي على عناصر الكربون والهيدروجين والاوكسجين والنتروجين واحيانا الكبريت (كل ما يحتويه تركيب جسم الكائن الحي مثلا البروتين يحوي تلك العناصر). وكذلك دراسة البنية تتضمن استخدام المطيافية (مثل رنين مغناطيسي نووي) ومطيافية الكتلة والطرق الفيزيائية والكيميائية الأخرى لتحديد التركيب الكيميائي والصيغة الكيميائية للمركبات العضوية. إلى عناصر أخرى و تشمل:- كيمياء عضوية فلزية و كيمياء عضوية لا فلزية.


إن هذا العلم متشعب و متفرع و له علاقة بعلوم أخرى كثيرة ويعرف بكيمياء الكائنات الحية على اختلاف أنواعها عن طريق دراسة المكونات الخلوية لهذه الكائنات من حيث التراكيب الكيميائية لهذه المكونات ومناطق تواجدها ووظائفها الحيوية فضلا عن دراسة التفاعلات الحيوية المختلفة التي تحدث داخل هذه الخلايا الحية من حيث البناء والتخليق، أو من حيث الهدم وإنتاج الطاقة .


علم يقوم على دراسة خواص وبناء مختلف المواد والجسيمات التي تتكون منها هذه المواد وذلك تبعا لتركيبها وبنائها الكيميائيين وللظروف التي توجد فيها وعلى دراسة التفاعلات الكيميائية والاشكال الأخرى من التأثير المتبادل بين المواد تبعا لتركيبها الكيميائي وبنائها ، وللظروف الفيزيائية التي تحدث فيها هذه التفاعلات. يعود نشوء الكيمياء الفيزيائية إلى منتصف القرن الثامن عشر . فقد أدت المعلومات التي تجمعت حتى تلك الفترة في فرعي الفيزياء والكيمياء إلى فصل الكيمياء الفيزيائية كمادة علمية مستقلة ، كما ساعدت على تطورها فيما بعد .





السيّد الصافي يكرّم كادر فيلم (أحمد والقمر) ويحثّهم على بذل المزيد
بمشاركة (450) عنوان ثقافي فكري من اصدارتها.. وزير الثقافة يزيح الستار عن جناح العتبة الحسينية في معرض بغداد الدولي للكتاب
سيرة أهل البيت (ع) وقصص الشهداء الملبين لفتوى (الدفاع الكفائي) أكثر ما يجذب رواد جناح العتبة الحسينية في معرض بغداد الدولي
العتبةُ العبّاسيةُ المقدّسة تُعلن عن موعد انعقاد مؤتمر فتوى الدفاع الكفائيّ الخامس