تقوم آلية التطور على أربعة عناصر.

1. الطفرة

وهي حدوث تغيير فجائي في المادة الوراثية نتيجة لعوامل مختلفة كالإشعاع أو المواد الكيماوية أو الحرارة المرتفعة وخلافه.

والأحياء التي تحتفظ بهذه الطفرات النافعة نتيجة الانتخاب الطبيعي تتطور.

2. إعادة الخلط

وتتم إعادة الخلط خلال الانقسام الاختزالي أو الميوزي للخلايا المنتجة للنطف خلط المورثات بأنماط جديدة وكثيرة. ويؤدى الخلط إلى تكوين أنواع كثيرة جديدة من النطف (الحيوانات المنوية والبويضات) والتي تتحد بعملية الاخصاب لتكوين أعداد جديدة من أفراد مختلفين. واحتمالات الخلط كبيرة جدا.

3. الانجراف الوراثي

وهو مبدأ تم اقتراحه لتوضيح التغييرات التي تطرأ على التردد النسبي للموروثات في الجماعات السكانية الصغيرة الحجم ففي هذه الجماعات تنتشر طفرة ما وترسخ خلال أجيال قليلة نسبيا إذا ما كان الانتخاب الطبيعي لصالحها.

كما يمكن أن تفقد مورثة ما من الجماعة فجأة خلال بضعة أجيال.

4. الانتخاب الطبيعي

وملخصه أن الكائنات الحية التي تتمتع بصفات إيجابية بالنسبة للبيئات التي تعيش فيها تتيسر لها فرص أكبر للبقاء من المخلوقات التي لا تملك مثل هذه الصفات.

أي أن الطبيعة بتعبير التطوريين والماديين تقوم بفرز وانتخاب الأنسب في الصراع الدائر من أجل البقاء.