النبات
مواضيع عامة في علم النبات
الجذور - السيقان - الأوراق
النباتات الوعائية واللاوعائية
البذور (مغطاة البذور - عاريات البذور)
الطحالب
النباتات الطبية
الحيوان
مواضيع عامة في علم الحيوان
علم التشريح
التنوع الإحيائي
البايلوجيا الخلوية
الأحياء المجهرية
البكتيريا
الفطريات
الطفيليات
الفايروسات
علم الأمراض
الاورام
الامراض الوراثية
الامراض المناعية
الامراض المدارية
اضطرابات الدورة الدموية
مواضيع عامة في علم الامراض
الحشرات
التقانة الإحيائية
مواضيع عامة في التقانة الإحيائية
التقنية الحيوية المكروبية
التقنية الحيوية والميكروبات
الفعاليات الحيوية
وراثة الاحياء المجهرية
تصنيف الاحياء المجهرية
الاحياء المجهرية في الطبيعة
أيض الاجهاد
التقنية الحيوية والبيئة
التقنية الحيوية والطب
التقنية الحيوية والزراعة
التقنية الحيوية والصناعة
التقنية الحيوية والطاقة
البحار والطحالب الصغيرة
عزل البروتين
هندسة الجينات
التقنية الحياتية النانوية
مفاهيم التقنية الحيوية النانوية
التراكيب النانوية والمجاهر المستخدمة في رؤيتها
تصنيع وتخليق المواد النانوية
تطبيقات التقنية النانوية والحيوية النانوية
الرقائق والمتحسسات الحيوية
المصفوفات المجهرية وحاسوب الدنا
اللقاحات
البيئة والتلوث
علم الأجنة
اعضاء التكاثر وتشكل الاعراس
الاخصاب
التشطر
العصيبة وتشكل الجسيدات
تشكل اللواحق الجنينية
تكون المعيدة وظهور الطبقات الجنينية
مقدمة لعلم الاجنة
الأحياء الجزيئي
مواضيع عامة في الاحياء الجزيئي
علم وظائف الأعضاء
الغدد
مواضيع عامة في الغدد
الغدد الصم و هرموناتها
الجسم تحت السريري
الغدة النخامية
الغدة الكظرية
الغدة التناسلية
الغدة الدرقية والجار الدرقية
الغدة البنكرياسية
الغدة الصنوبرية
مواضيع عامة في علم وظائف الاعضاء
الخلية الحيوانية
الجهاز العصبي
أعضاء الحس
الجهاز العضلي
السوائل الجسمية
الجهاز الدوري والليمف
الجهاز التنفسي
الجهاز الهضمي
الجهاز البولي
المضادات الحيوية
مواضيع عامة في المضادات الحيوية
مضادات البكتيريا
مضادات الفطريات
مضادات الطفيليات
مضادات الفايروسات
علم الخلية
الوراثة
الأحياء العامة
المناعة
التحليلات المرضية
الكيمياء الحيوية
مواضيع متنوعة أخرى
الانزيمات
UniProt Database
المؤلف:
د.زهرة محمود الخفاجي
المصدر:
موسوعة الحياة
الجزء والصفحة:
2-9-2020
2317
UniProt Database
قاعدة بيانات (Universal Protein Resource) أنشأت من دمج قواعد أخرى وتعد الأساس في التعامل مع البروتينات نظرا" لسهولة التعامل معها ولها تطبيقات واسعة . والمعلومات فيها تكون على ثلاث مستويات
- المستوى الأول UniProt Knowledge Database) UniProt KB ) ويعد هذا الأساس او المنطلق للوصول الى البيانات الدقيقة حول البروتين من حيث الوظيفة والتصنيف وغيرها من النواحي ، وهذه تكون مربوطة بقاعدة البيانات السويسرية و TrEMBL وتختلف كمية المعلومات والتطابقات وفق القاعدة المستعملة وبشكل خاص فأن قاعدة البيانات السويسرية تكون الأفضل لأنها الأوسع .
- المستوى الثاني Reference Cluster Database ) UniRef ) وهذا المستوى يزود بمعلومات حول المجاميع العنقودية للبروتينات الموجودة في المستوى الأول التي لها تماثل في التواليات يتراوح بين 100 % ثم 90 % ثم 50% .
- المستوى الثالث Archive Database ) Unipare) وهو مستوى من القاعدة تحوي كافة المعلومات العامة المتوفرة حول تواليات البروتينات الموجودة في القاعدة .
قاعدة Munich Information Center for Protein Sequences) MIPS) القاعدة توفر إمكانيات كبيرة لدراسة البروتينات ، اذ يمكن بواسطتها اختيار الكائنات الحية المرتبة وفق النظام الهجائي ، وكل مدخل منها يرتبط ب NCBI وقواعد تصنيفية . وتوفر القاعدة البروتينات المراد التحري عنها واصطفاف لأفضل تطابقات BLAST المتوفرة ، وفي حالة الجينومات غير المكتملة تظهر القاعدة المناطق المجاورة . وتكون الجينات المشفرة للبروتينات مفصولة عن تلك الخاصة ب RNA والتي تكون مفصلة بدورها الى tRNA , rRNA والجزيئات الأخرى فضلا" عن إدراج تراكيب العروة Stem – Loop Structures لهذه الجزيئات . وتوفر القاعدة بيانات أخرى كثيرة منها إدراج البحوث والنشرات حول الموضوع