قتاله (عليه السلام) الناكثين والقاسطين والمارقين وهم أهل الجمل وصفين والخوارج : روى النسائي في الخصائص بسنده عن زر بن حبيش انه سمع عليا يقول أنا فقأت عين الفتنة لولا أنا ما قوتل أهل النهروان وأهل الجمل ولولا إنني اخشى أن تتركوا العمل لأخبرتكم بالذي قضى الله لسان نبيكم لمن قاتلهم مبصرا ضلالتهم عارفا بالهدى الذي نحن عليه .

وفي حلية الأولياء بسنده عن زر عن علي قال انا فقأت عين الفتنة ولو لم أكن فيكم ما قوتل فلان وفلان وفي الاستيعاب روي من حديث علي ومن حديث ابن مسعود ومن حديث أبي أيوب الأنصاري إن عليا أمر بقتال الناكثين والقاسطين والمارقين .

قال وروي عنه أنه قال ما وجدت إلا القتال  أو الكفر بما انزل الله يعني والله أعلم قوله تعالى {وَجَاهِدُوا فِي اللَّهِ حَقَّ جِهَادِهِ } [الحج: 78] وما كان مثله اه .

وفي الاستيعاب بسنده عن ابن عمر : ما آسي على شئ إلا اني لم أقاتل مع علي الفئة الباغية وفي رواية أن لا أكون قاتلت الفئة الباغية على صوم الهواجر قال وقال الشعبي ما مات مسروق حتى تاب إلى الله من تخلفه عن القتال مع علي قال ولهذه الأخبار طرق صحاح قد ذكرناها في موضعها وفي أسد الغابة بسنده عن أبي سعيد الخدري امرنا رسول الله (صلى الله عليه واله) بقتال الناكثين والقاسطين والمارقين فقلنا يا رسول الله أمرتنا بقتال هؤلاء فمع من فقال مع علي بن أبي طالب معه يقتل عمار بن ياسر وبسنده عن مخنف بن سليم أتينا أبا أيوب الأنصاري فقلنا قاتلت بسيفك المشركين مع رسول الله (صلى الله عليه واله) ثم جئت تقاتل المسلمين قال امرني رسول الله (صلى الله عليه واله) بقتال الناكثين والقاسطين والمارقين وبسنده عن علي بن ربيعة سمعت عليا على منبركم هذا يقول عهد إلي رسول الله (صلى الله عليه واله) ان أقاتل الناكثين والقاسطين والمارقين .

وروى الحاكم في المستدرك بسنده عن أبي أيوب الأنصاري أمر رسول الله (صلى الله عليه واله) عليا بقتال الناكثين والقاسطين والمارقين وبسنده عن أبي أيوب سمعت النبي (صلى الله عليه واله) يقول لعلي بن أبي طالب تقاتل الناكثين والقاسطين والمارقين بالطرقات والنهروانات وبالسعفات قال أبو أيوب يا رسول الله مع من نقاتل هؤلاء الأقوام قال مع علي بن أبي طالب .